2022年2月22日,我校生命科学学院余国营教授与复旦大学附属上海市公共卫生临床中心张驰宇研究员合作的研究论文《Multiplex, Real-Time,Point-of-care RT-LAMP for SARS-CoV-2 Detection Using the HFman Probe》,在线发表在美国化学会重要学术期刊《ACS SENSORS》(中科院分区一区TOP)。
核酸检测是目前世界上检测新冠病毒的标准方法,其中,基于RT-qPCR的核酸检测技术被公认为SARS-CoV-2确诊的金标准,但受限于其较长的检测时长、以及对昂贵仪器和专业人员的高度依赖性。因此,对简便、快速、特异、灵敏的核酸床边诊断(POCT)技术提出了紧迫的需求。环介导的恒温扩增技术(LAMP)是目前最受关注的核酸POCT诊断技术,然而存在非特异性扩增、无法单管多重检测、容易漏检等问题。
本研究针对以上问题,团队建立了一种耐突变、多重荧光RT-LAMP检测技术。利用该技术,团队开发了针对新冠病毒ORF和E基因以及人类管家基因β-actin的单管三重LAMP检测体系,实现高特异性和高灵敏度(3-30拷贝每反应)检测。临床样品评估显示,其检测灵敏度为94.5%,特异性为100%,与商业RT-qPCR试剂盒相比检测一致率为96.8%。采用样本核酸免提取方案,该方法仅需要一个可以恒温加热的设备,结合一个465nm的LED蓝光灯,即可实现45min内从采样到可视化结果读取,可应用于社区或野外快速即时(POCT)检测。
该研究由生命科学学院与上海市公共卫生临床中心、英国Glasgow大学,上海市国际旅游健康中心合作完成,我校硕士生东亚娟为第一作者,生命科学学院为第一作者单位,上海市公共卫生临床中心赵勇娟为共同第一作者,张驰宇研究员,Jonathan M. Cooper,田桢干主任为共同通讯作者。此外,研究团队前期为了筛选更高效的LAMP引物用于SARS-CoV-2的POCT检测,我们比较评估了19套已经发表的SARS-CoV-2的LAMP引物,并从中筛选出5套扩增效率高,特异性好的LAMP引物,推荐用于SARS-CoV-2的高灵敏POCT检测和筛查。文章以东亚娟为第一作者发表在Sci Report 2021, Feb3;11(1):2936.
文章链接:https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acssensors.1c02079